Stato del progetto: Concluso
Centro coordinatore: IRCCS ICS Maugeri, Pavia (IT)
Ambito: Cardiologia
Data inizio: 01 Gennaio 2011
Piattaforma: i2b2
Il progetto CARDIO-i2b2 ha l’obiettivo di personalizzare la piattaforma bioinformatica i2b2 per integrare dati clinici e di ricerca al fine di supportare la ricerca traslazionale in cardiologia in FSM (Fondazione Salvatore Maugeri). CARDIO-i2b2 raccoglie i dati provenienti dai database del Laboratorio di Cardiologia Molecolare e li unisce ai dati clinici del sistema TRIAD, un sistema informativo per raccogliere i dati relativi a patologie aritmogeniche. Sono raccolte anche le informazioni genetiche relative ai pazienti affetti.
I dati contenuti nel database relazionale TRIAD sono stati esportati nel data warehouse i2b2. Un’apposita estensione di i2b2 è stata sviluppata per includere il software statico R all’interno dell’architettura e sfruttare le funzionalità statistiche di R tramite l’interfaccia web i2b2. Per consentire ai ricercatori di eseguire dinamicamente l’analisi di sopravvivenza di Kaplan-Meier su pazienti selezionati è stato sviluppato un plugin apposito (Figura 1).
Riferimenti:
Segagni D, Tibollo V, Dagliati A, Napolitano C, G Priori S, Bellazzi R. (2012) CARDIO-i2b2: integrating arrhythmogenic disease data in i2b2. Stud Health Technol Inform.180:1126-8. (link, pdf)
Segagni D, Tibollo V, Dagliati A, Malovini A, Zambelli A, Napolitano C, Priori SG, Bellazzi R. Clinical and research data integration: the i2b2-FSM experience. AMIA Jt Summits Transl Sci Proc. 2013 Mar 18;2013:239-40. eCollection 2013. (link)
